最新版更新してからチェックアウトする、のロジックではメソッド間に別環境からゼロ時間チェックアウト+チェックインがあると不整合が起こるはず。
少なくともAPIのレイヤーでは、「refreshしてagentcodeのcheckOut状態を変更する / 衝突で失敗」の機能を提供するべき。
